您现在的位置: 首 页 >> 经济论文 >> Y染色体STR基因座的异常基因类型研究

Y染色体STR基因座的异常基因类型研究

作者:赏识教育
出处:www.lunrr.com
时间:2019-11-05

Y染色体上有BP核苷酸,其中95%为非重组区。该区域的遗传多态性位点构成了整个基因组中信息最丰富,最稳定的单倍型,反映了男性个体之间独特的遗传和进化关系。在法医鉴定领域,Y-STR可以直接确定男女混合斑块的Y-单倍型,而无需分离和提取DNA,这使得检测不仅简单而且非常有效。 Y-STR分型结果中其他基因的存在通常被解释为多种生物的混合物。这项研究的目的是探索更多的Y-STR遗传信息,并为法医鉴定提供证据。在11个标本中发现了Y-STR的异常分型结果,包括STR位点的其他基因或基因缺失,如下所述。

1材料与方法

1.1研究课题

我们实验室从2010年至2014年进行的亲子鉴定病例。将男孩的病例分为两组:组(不包括亲子鉴定),49组,98个样本;第一组,支持亲子鉴定,252例,509个标本,包括一个有3个儿子的家庭和3个有2个儿子的家庭。除了一个家庭是壮族,其余都是汉族。他们大多数属于南方汉族。

1.2试剂和仪器

Chelex100(美国SIGMA,批次: SLBG4989V); AmpFlSTRYfilerTM试剂盒(美国Applied Biosystems,批次:); LIZ500(美国Applied Biosystems,批次:); PowerPlexY23系统套件(美国Promega,批号:); CC5ILS500(美国Promega,批次:)Hidi(美国应用生物系统,批次:);电泳缓冲液10хbuffer(US Applied Biosystems,批号:); POP-4凝胶(美国应用生物系统公司,批号:)。 PCR扩增仪(9700,美国基因有限公司); 3130xl GeneticAnalyzer(美国应用生物系统公司)。

1.3方法

1.3.1 DNA的提取使用Chelex方法从外周抗凝中提取DNA。

1.3.2 PCR扩增通过AmpFlSTRYfilerTM试剂盒扩增Y染色体上的16个STR基因座。

1.3.3 PCR产物的电泳分析使用ABI3130XL型测序仪对PCR产物进行电泳,毛细管长度为36 cm,进样时间为15 s,进样电压为1.5 kV,PCR产物用量为1.0μL。通过GeneMapperID-X软件(Applied Biosystems)分析产生的数据文件。版本号: 1.4)。

1.3.4重复验证使用PowerPlexY23system试剂盒反复验证了分析结果中获得的异常基因型。

1.4异常基因型发生率的计算以病例数(252例)计算一组“支持父子关系”。将“不包括父子关系”的组视为随机人群,并计算样本数(98)。

2个结果

2.1单倍型和基因突变分开报道。

2.2异常的基因型图谱在“支持父子关系的组”中,除了单个基因的一步突变外,还有9个样本显示异常的基因型图谱。第一对父子DYS385位点是一个三波段图谱(13,14,18),峰高比约为1:1:1;第二对父子,DYS385基因座是一个四波段图谱(13、17、18、20),峰高比约为2:1:1:1。第三对父子,DYS385位点是四波段模式(13、18、19、21),峰高比约为2:1:1:1;第四对父子,DYS439基因座是一个双基因图谱(12,13),峰高比约为1:1。第五对父子的DYS389II基因座是双基因图谱(28,29)的峰高比约为1:1,而其父亲具有正态图谱,即单基因(28)。

2.3基因缺失的STR基因型图谱“不包括父子关系”样本中的两个样本在DYS448位点均具有基因缺失。

2.4在单个基因座中多个基因和基因缺失的发生率分别为1.4%(5/350)和0.57%(2/350)。

2.5重复的异常基因型验证图。

3讨论

短串联重复序列(STR)是由2-6个碱基组成的核心序列,以串联重复序列排列。由于个体之间的重复数不同,因此STR具有高度的多态性。因为在减数分裂过程中Y染色体不与其他染色体重组,所以常见的Y-STR位点是连锁的。样品中只有一个基因(一个条带)。在司法领域,通过Y-STRs鉴定混合噬菌斑中的男性DNA非常方便,有效,可以直接确定Y单倍型而无需分离和提取DNA。 Y-STR中多余基因的存在通常被解释为多种生物的混合物,因此在轮奸案中,Y-STR通常用于确定参与者的数量。

报道了9个标本中一个Y-STR基因座多个基因的异常分型结果。 DYS439和DYS389 II是具有双基因的基因座,而DYS385是具有三个和四个条带的基因座。国内文献还报道了在公共安全系统的每日累积样本中出现了3例DYS385病例,而没有报告四频带类型。 DYS439和DYS389 II基因座已在国外报道,但在中国没有报道。 DYS385具有良好的遗传多态性,也是一个非常特殊的基因座。在常见的Y-STR基因座中,只有DYS385通常检测到两种单基因型或双基因型,结果为。这是因为DYS385在Y染色体上有一个重复区域。序列分析表明,除了点突变外,两个片段之间的侧翼区域序列和重复单元没有系统上的差异。区别仅在于重复单位的数量。当两个区域中重复单元的数目相同时,我们检测到单个基因。如果重复单元的数目不同,则我们检测到双重基因。

在本研究中,除了显示出异常基因型的DYS385标本外,基因型与基因座基因型的比例约为43:7(“ 1个支持父子关系”是根据病例数计算的)。除DYS385位点外,其他15个Y-STR位点的结果均正常。 3对父子DYS385基因座检测到三带或四带型,可能是染色体的减数分裂变异,增加了1个片段,2个片段甚至3个片段的重复,产生了DYS385的一对引物和3个,四个或五个基因座组合在一起。 DYS385基因座中一个基因峰的峰高约为其他基因的峰高的两倍,这可能是两个重复区域中相同数目的串联重复序列的加和效应。从文本中父子的情况来看,这种变化可以被稳定地继承。在本文中,据报道三个标本在DYS439和DYS389II位点具有双重基因。对此观察的最好解释是片段重复的存在,该片段重复导致PCR引物与重复序列的结合。两个基因座DYS439和DYS389II位于Y染色体的同一区域-无精子因子a(AZFa)区域,该区域具有780 kb,包含9个已知的常用Y-STR基因座。 Bosch和Jobling将AZFa重复描述为两个10 kb人类内源性逆转录病毒因子(HERV)侧翼区域之间重组的相互产物。由于我们使用的STR检测方法无法准确量化,因此在实际工作中很难确定增加的相对峰高,因此,如果STR核心序列的拷贝数在重复区域中相同,则很难确定重复的存在。这可能是很少报告双基因或多基因的原因。

在这项研究中,发现两个标本在DYS448位点具有基因缺失。基因缺失通常是由DNA模板的降解引起的。但是,在标本中,相似大小的片段(DYS389II,DYS385,DYS392)得到了很好的扩增,表明标本的打字损失不是由模板DNA的降解引起的。使用PowerPlexY23系统试剂进行的重复实验也证实了这一点。基因缺失的最可能原因是Y染色体上区域的序列发生突变或基因转化,从而导致引物结合的位置序列发生变化。这需要重新设计引物以确定用于研究确认的区域的序列。 Wu Weiwei等报道,基因型缺失的频率为0.518%,DYS458缺失在4477个样本中发生一次,而DYS456缺失则发生37次。没有关于缺乏DYS448的报道。在我们的研究中,基因分型缺失的频率为0.57%,与文献报道的数据相近。

综上所述,Y-STR基因座中多基因和常染色体STR的三带类型在机制上是完全不同的,这仅仅是一个重复事件的结果。 M. Diederiche等人报告了一个更为罕见的案例,其中巴西男性在三个Y-STR(DYS437,DYS439和DYS389II)中显示双基因。因此,在法医鉴定中,双基因的存在是否意味着多个男性个体的DNA混合,需要仔细分析更多的Y-STR基因座结果以进行综合分析。

最新论文
关于旅游职业教育校企合作创新的实践与探索
关于土木工程力学课程中发展性学习评价
Y染色体STR基因座的异常基因类型研究
高校基础化学实验中信息化教学的优势及策略
企业全面预算内部控制体系建设对部门职能的优化整合作用分析
关于成都男司机打女司机案件的法律约制
关于土木工程力学课程中发展性学习评价
以职业能力培养为中心的《网页制作》课程教学改革分析
高校基础化学实验中信息化教学的优势及策略
全球管理会计原则下解读会计管理活动
1990-2012年上海市法院适用国际条约情况研究
高校基础化学实验中信息化教学的优势及策略
热门论文
从公共政策执行障碍的角度分析新农保
试析小学数学课程中道德教育资源的渗透
中小企业进销存管理系统的分析与设计
生活化语文教学在高中语文教学中的应用
关于Java的在线鲜花定购系统的研究
四年级数学综合实践活动中微课程教学的应用
“三江你我他”网络服务平台设计与实现探究
多元智能理论下的小学语文识字教学研究
从《孤独美食家》看日本美食电视剧
“营改增”对无形资产核算的影响
从音乐美学看音乐作品的存在方式
关于社会治理视阈下《回疆则例》的立法考察
2014年汽车ADAS技术的最新进展分析
热门标签
日期归档
2019年11月
2019年10月
2019年09月