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我国完成31个大豆基因组重测序

作者:学报期刊
出处:www.lunrr.com
时间:2020-02-02

资料来源:中国新闻网,发布日期:2010年

选择名称:萧中

中国完成31个大豆基因组重排序

本研究为大豆育种提供了重要信息

由香港中文大学、华大基因研究所、农业部、中国科学院等单位联合开展的“大豆家园”项目的研究成果,“31个大豆基因组重排序揭示遗传多样性和进化选择模式”于11月14日在线发表在国际着名杂志《自然—遗传学》上

本研究首次对野生大豆和栽培大豆全基因组进行大规模遗传多态性分析,为全球大豆遗传研究、大豆种质资源保护和分子育种提供了宝贵资源,有助于农业发展

据悉,这是中国科学家首次在大豆之乡中国完成大规模大豆基因组计划,打破了发达国家在高端大豆研究方面的垄断。这也是内地与香港紧密合作实现重大科学突破的典范。

据报道,研究人员使用下一代测序技术对17种野生大豆和14种栽培大豆的整个基因组进行了重新测序。肥皂软件v2.18被用来与大豆的参考基因组进行比较。共发现630多万个单核苷酸多态性,并建立了高密度分子标记图谱。 同时,利用SOAPdenovo软件对野生大豆和栽培大豆进行组装,鉴定了180,000多种大豆的获得和丢失变异,获得了栽培大豆获得和丢失的基因。

华大基因研究人员表示,大豆基因组不同于其他作物,因为大豆具有高度的基因连锁不平衡和高比例的单核苷酸非同义替换/同义替换比率。 这一发现表明分子标记育种在大豆育种中可能比基因图谱克隆更有优势。

香港中文大学项目主任林汉明(Lin Hanming)表示,作为内地与香港科学合作史上的里程碑式科学研究,研究所产生的大量基因组数据可以促进未来大豆研究,为大豆育种提供重要信息。 香港中文大学和华大遗传研究所的研究人员将把作物科学、分子生物学和下一代测序技术结合起来。研究成果将进一步深化大豆的科学研究和合理开发,为农业做出贡献。

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《自然—遗传学》 Published Abstracts of Papers(English)

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